Tout instrument de mesurage doit être étalonné avant d'effectuer des mesures y compris les MMT. L'étalonnage du palpeur consiste à palper une sphère de palpage dont le centre devient l'origine du repère des mesures. Si le palpeur comporte plusieurs stylets, l'étalonnage doit être réalisé pour chacun des stylets. Les stylets étant démontables, cette opération d'étalonnage est un préalable au mesurage de pièces. On ne mesure pas directement le diamètre du palpeur avec un micromètre tout simplement pour tenir compte du temps de déclenchement de la tête de mesure qui n'est pas négligeable. Le diamètre calculé à l'issue du palpage de la sphère d'étalonnage est toujours plus petit que le diamètre réel mesuré avec un micromètre. L'écart est d'autant plus grand que le stylet est éloigné du palpeur notamment si on utilise une rallonge.